Okulumuz 1994 yılında Çayırova Mahallesi içerisinde 57 pafta,2 Ada,4 Nolu parsel üzerinde 5190 metre kare ve maliye hazinesi üzerine 1200 metre kare kullanım alanlı 12 derslikli 10746-y1 proje ile Ticaret Lisesi olarak temeli atılıp; 1998–1999 öğretim yılında 467 öğrenci ile eğitim öğretime açılmıştır.
2005–2006 eğitim öğretim yılında Anadolu Ticaret Meslek Lisesi kısmı açılmış olup 60 öğrenci ile eğitim öğretime başlamıştır. Halen 24 derslik, 7 bilgisayar laboratuvar, 1 kütüphane, 1 konferans salonu, 1 kapalı spor salonu ve okul bahçesinde basketbol – voleybol sahası bulunmakta olup, 822 öğrenci ile eğitim öğretime devam etmektedir.
Okulumuz 1998 yılında Çayırova Ticaret Meslek Lisesi olarak açılmıştır. 2008 yılında ilçelerin ayrılmasıyla ismi Gebze Ticaret Meslek Lisesi olarak değiştirilmiş, 2014 yılında ise Genel Müdürlüklerin birleşmesiyle Fatih Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi adını almıştır.
Okulumuzun ilk mezunları 2001 yılında verilmiştir. 2001 yılından bugüne kadar okulumuzdan 5974 öğrenci mezun olmuştur. Mezun olan öğrencilerimiz içerisinden, mezun oldukları alan veya alan dışında 2 yıllık meslek yüksek okulu ve 4 yıllık fakültelere yerleşmektedirler. Üniversitelere yerleşen öğrenci sayımız her geçen yıl artmaktadır. Üniversiteye yerleşmeyen öğrencilerimizde bulunduğumuz bölgenin sanayi bölgesi olması nedeniyle staj yaptıkları işletmelerde istihdam edilmektedir.
Okulumuz 1998 yılında Ticaret Meslek Lisesi Programında Muhasebe bölümü olarak eğitim öğretim faaliyetlerine başlamıştır. Ticaret Meslek Programında 2006 yılında Büro Yönetimi ve Sekreterlik Alanı Açılmış 2012 Yılında Büro Yönetimi Alanı (Ticaret Sekreterliği Dalı) olarak devam etmiştir. Muhasebe bölümü ise 2005 yılında Muhasebe Finansman Alanı (Bilgisayarlı Muhasebe Dalı) adını almıştır. 2005 yılında Anadolu Ticaret Meslek Lisesi programı açılmıştır. Bu programda Muhasebe Finansman Alanı (Muhasebe ve Dış Ticaret Ofis Hizmetleri Dalları) ve Bilişim Teknolojileri Alanında (Web Programcılığı Dalı) eğitim verilmiştir. 2015 yılında ise Anadolu Meslek Programı açılmış, bu programda Muhasebe ve Finansman Alanı (Muhasebe Dalı), Bilişim Teknolojileri Alanında (Yazılım Geliştirme Dalı) ve Büro Yönetimi ve Yönetici Asistanlığı Alanında (Büro Yönetimi ve Yönetici Asistanlığı Dalı) eğitim verilmektedir.
